BioArchLinux 是生物工作者的 Arch Linux 社区,它包含了一个生物信息学软件的 Arch Linux 仓库。
下载地址:https://mirrors.adysec.com/system/bioarchlinux
运行以下命令
x
echo -e "[bioarchlinux]\nServer = https://mirrors.adysec.com/system/bioarchlinux/\$arch" >> /etc/pacman.conf
pacman-key --recv-keys B1F96021DB62254D
pacman-key --finger B1F96021DB62254D
pacman-key --lsign-key B1F96021DB62254D
pacman -Syy
pacman -S pkg_name
BioArchLinux 仓库在可能的情况下,在每个包描述中提供了一个 DOI。 这使用户能够轻松地了解有关每个包的用途和方法的更多信息,并在准备出版物时快速识别适当的引用。
xxxxxxxxxx
pacman -Ss doi_number
pacman -Qi pkg_name
在 WSL 中使用 BioArchLinux
另外,当 Windows 和 macOS 用户需要使用 Linux 环境来运行生物信息软件的时候,也可以轻松使用 BioArchLinux。因为 BioArchLinux 同样提供 WSL 以及 Docker 镜像。
对于 Windows 用户优先推荐 WSL,因为 Docker 在 Windows 下依赖 WSL。只需要在任意一个镜像站点的 wsl
文件夹下找到 tar
文件即可。解压它,在安装了 wsl
的前提下双击 BioArch.exe
文件,就可以开始成功安装,安装好后键入下述命令即可进入:
wsl -d BioArch